Dla algorytmu nie stanowi to żadnego problemu. Standardowym rozwiązaniem w takiej sytuacji jest umieszczenie w opisie przelewu numerów opłacanych faktur lub zamówień, oddzielonych od siebie przecinkiem (lub innym ustalonym znakiem). System automatycznie rozpozna ten separator i poprawnie przypisze rozbite kwoty do odpowiednich dokumentów w systemie.
