Tak, podatnicy opodatkowani ryczałtem od dochodów spółek (CIT estoński) również są objęci nowymi przepisami, jednak zakres raportowanych przez nich danych jest nieco inny. Skupiają się oni przede wszystkim na strukturze dotyczącej środków trwałych (JPK_ST_KR), ponieważ ich wynik podatkowy jest ustalany na innych zasadach niż w klasycznym CIT.